Revista Farmabiotec Número 25

#25 farmaBIOTEC 43 eventos de splicing alternativo e isoformas transcriptómicas complejas. La secuenciación de ARN por lecturas largas permite analizar moléculas completas de ARN en una sola lectura, eliminando gran parte de la ambigüedad asociada al ensam - blaje computacional. Esto facilita la identificación precisa de puntos de ruptura, exones implicados, variantes de splicing y transcritos de fusión completos. El avance resulta especialmente relevante en sarcomas, linfomas y leucemias, enfermedades donde las fusiones génicas son determinantes diagnósticos y terapéuticos. En el sarcoma de Ewing, por ejemplo, aproximadamente el 85-90% de los casos presentan fusiones EWSR1-FLI1 , fun- damentales para confirmar el diagnóstico molecular. En leu - cemias, alteraciones como BCR-ABL1, RUNX1-RUNX1T1 o los reordenamientos de KMT2A condicionan el pronóstico y la selección terapéutica (Jain & Cortes, 2025). De forma simi - lar, fusiones como NPM1-ALK permiten identificar pacientes con linfoma anaplásico de células grandes candidatos a tera- pias dirigidas frente a ALK . Más allá de detectar fusiones génicas Uno de los principales beneficios de la transcriptómica de lectura larga es que no solo detecta la existencia de una fusión genética, sino también si esa alteración se expresa realmente y genera un transcrito funcional. Esta capacidad aporta información clínica de gran valor. Algunas fusiones detectadas a nivel genómico pueden no traducirse en proteínas activas, mientras que otras generan isoformas aberrantes asociadas a resistencia terapéutica o mayor agresividad tumoral. Además, LR-RNASeq permite identificar eventos de spli- cing alternativo y cuantificar distintas isoformas transcrip - tómicas. En tumores como el rabdomiosarcoma, el linfoma difuso de células B grandes o determinadas leucemias agu- das, diferentes isoformas de un mismo gen pueden aso- ciarse a comportamientos biológicos distintos y respuestas terapéuticas variables. Impacto diagnóstico y reclasificación tumoral Diversos estudios recientes demuestran que la incorpora- ción del análisis transcriptómico mejora significativamente el rendimiento diagnóstico respecto a las técnicas conven- cionales basadas exclusivamente en ADN. La secuenciación de ARN puede aumentar hasta en un 15% la tasa diagnóstica en casos previamente negativos tras secuenciación de exoma (Peymani et al., 2022). En sarcomas pediátricos, el uso de RNA-Seq ha permitido confirmar o refinar diagnósticos complejos e identificar alteraciones relevantes en tumores inicialmente indiferenciados (Ichikawa et al., 2021). En algunos subtipos de sarcoma, la integración del análi- sis transcriptómico ha permitido reclasificar hasta un 15% de los casos al identificar fusiones o alteraciones que habían pasado desapercibidas con otras metodologías (Zhang et al., 2022). Esta reclasificación tiene un impacto directo sobre el tratamiento, ya que muchos de estos tumores dependen de alteraciones moleculares concretas para definir su abordaje terapéutico. En leucemia linfoblástica aguda de precursores B, estudios internacionales con más de 1.200 pacientes han demostrado Terapias avanzadas