Revista Farmabiotec Número 25

44 farmaBIOTEC #25 que el RNA-Seq mejora la clasificación molecular y la estrati - ficación pronóstica, facilitando una medicina más personali - zada (Li et al., 2018). Importancia del tejido fresco y de los protocolos optimizados para ARN de lectura larga Uno de los principales retos técnicos de la transcriptómica de lectura larga es preservar la integridad de moléculas de ARN de gran tamaño. A diferencia de las aproximaciones convencionales basadas en lecturas cortas, la calidad del ARN de partida resulta crítica para obtener transcritos com- pletos y caracterizar correctamente isoformas y fusiones génicas. Por este motivo, las estrategias más avanzadas de LR-RNASeq se están desarrollando preferentemente sobre muestras de tejido fresco o criopreservado, donde la degra - dación del ARN es significativamente menor que en muestras fijadas en formalina e incluidas en parafina (FFPE). Además, la generación de librerías de lectura larga requiere protocolos específicos de extracción, captura e hibridación capaces de minimizar la fragmentación del ARN y preservar transcritos completos de interés clínico. El desarrollo de protocolos optimizados para tejido fresco representa actualmente uno de los principales desafíos para trasladar la transcriptómica de lectura larga desde el ámbito experimental hacia aplicaciones diagnósticas de alta complejidad. De la investigación a la práctica clínica Hasta hace pocos años, las tecnologías de lectura larga estaban prácticamente limitadas al ámbito de la investiga- ción debido a su complejidad técnica y coste. Sin embargo, los avances recientes en la química de secuenciación y el análisis bioinformático han acelerado su transición hacia la práctica clínica. Plataformas de tercera generación desarrolladas por com - pañías como Pacific Biosciences (PacBio) permiten actual - mente obtener lecturas de alta fidelidad capaces de anali - zar transcritos completos con precisión clínica. En España, Health in Code es la única empresa de diagnóstico que cuenta con esta tecnología. Este salto tecnológico abre nuevas posibilidades para el diagnóstico oncológico de precisión. La identificación simul - tánea de fusiones génicas, isoformas aberrantes y patrones de expresión puede mejorar la selección terapéutica y resol - ver casos clínicos complejos que permanecían sin caracteri - zación molecular concluyente. Aunque actualmente su aplicación clínica es todavía limitada, la transcriptómica de lectura larga representa una aproximación prometedora para complementar las estra - tegias convencionales de diagnóstico molecular, especial- mente en patologías con elevada complejidad transcriptó - mica y estructural. Referencias • Ichikawa, D., Yamashita, K., Okuno, Y., Muramatsu, H., Murakami, N., Suzuki, K., Kojima, D., Kataoka, S., Hamada, M., Taniguchi, R., Nishikawa, E., Kawashima, N., Narita, A., Nishio, N., Hama, A., Kasai, K., Mizuno, S., Shimoyama, Y., Nakaguro, M., … Takahashi, Y. (2021). Integrated diagnosis based on transcriptome analysis in suspected pediatric sar- comas. NPJ Genom Med 6(1), 49. https://doi.org/10.1038/ s41525-021-00210-y • Jain, A. G., & Cortes, J. E. (2025). Asciminib: the tyrosine kinase inhibitor with a unique mechanism of action. Expert Opin Pharmacother. https://doi.org/10.1080/14656566.2025.2480762 • Peymani F, Farzeen A, Prokisch H. RNA sequencing role and application in clinical diagnostic. Pediatric Investigation. 2022;6(1):29–35. doi:10.1002/ped4.12314. • Zhang Y, Chen X, Liu Y, et al. Development and valida - tion of an RNA sequencing panel for gene fusions in soft tissue sarcoma. Cancer Science. 2022;113(5):1843–1854. doi:10.1111/cas.15317 • Li JF, Dai YT, Lilljebjörn H, et al. Transcriptional landscape of B cell precursor acute lymphoblastic leukemia based on an international study of 1,223cases. Proceedingsof theNational Academy of Sciences USA. 2018;115(50):E11711-E11720. doi:10.1073/pnas.1814397115 Terapias avanzadas