Revista Farmabiotec Número 5
56 farmaBIOTEC #5 Identificación de biomarcadores farmacogenéticos La variabilidad genética es la cantidad de genotipos diferentes que hay en una determinada población. Esta variabilidad es la que hace que todos los individuos seamos diferentes entre nosotros, y que tengamos características distintas. También es la base de la medicina de precisión, que se vale del conocimiento de esta variabilidad interindividual para la aplicación de los tratamientos más adecuados a cada paciente. GINEVRA BONELLI, Departamento de Genética Clínica de Dreamgenics. LEYRE LARZABAL, Departamento de Genética Clínica de Dreamgenics. El proceso de determinar qué variantes genéticas posee cada individuo se denomina genotipado. Mediante el geno- tipado, se detectan las diferencias entre la secuencia del ADN del individuo a estudiar y una secuencia de referen- cia, identificando así las variantes que posee el paciente. El tipo de variante genética más común en humanos son las Single Nucleotide Variants (SNVs) que son cambios en el ADN de una sola letra. Se conocen más de 660 millones de SNVs en el genoma humano, y son la base de la diver- sidad fenotípica de las diferentes poblaciones e individuos como, por ejemplo, el color de ojos, piel y pelo, pero tam- bién de la predisposición o la causa del desarrollo de cier- tas enfermedades. Esta variabilidad genética es también la base de los biomarcadores genéticos: variantes de los ácidos nucleicos, tanto del ADN como del ARN, que pue- den medirse y que actúan como indicador de un proceso biológico normal, patogénico y/o de respuesta farmaco- lógica u a otras intervenciones. Determinar las variantes genéticas, es decir, el genotipo de un individuo permite conocer su riesgo a desarrollar una determinada enferme- dad o la respuesta que va a presentar a un determinado fármaco. Precisamente, el estudio de dichas diferencias en ADN y ARN que se relacionan con la respuesta a fármacos es lo que se conoce como farmacogenómica (PGx), mien- tras que la farmacogenética (PGt) es un subconjunto de esta en la que solamente se estudian las diferencias del ADN. De hecho, los factores genéticos explican entre un 15 y un 30% de la variabilidad en el metabolismo de los fármacos (absorción, distribución y metabolismo) y la res- puesta a ellos. Para ciertos fármacos específicos o grupos de fármacos, hasta el 95% de la respuesta observada entre diferentes individuos puede deberse a causas genéticas. Detección de biomarcadores en farmacogenética Hoy en día, cerca de 450 fármacos disponen de informa- ción relativa a variantes génicas que pueden alterar nues- tra respuesta a ellos, afectando a su metabolismo, eficacia o toxicidad y se requiere o se recomienda la realización de pruebas genéticas específicas antes de su administra- ción a los pacientes. En el caso de la Unión Europea, es la Agencia Europea de Medicamentos (EMA) quien se ocupa de publicar la información relacionada con los diferentes fármacos y de establecer cuales requieren una prueba genética, para cuáles se recomienda realizarla, y para cuá- les hay variantes accionables conocidas. La mayoría de estudios genéticos se basan en la determinación del geno- tipo para un determinado gen. Puesto que la EMA no deta- lla un método específico para llevar a cabo dichos estu- dios, pueden emplearse diversas técnicas de genotipado. Las técnicas basadas en hibridación son relevantes debido a su alto rendimiento, sobre todo las técnicas de microarray, que son las más utilizadas para la detección de biomarcadores. Según Huebner et al. (2022), de los 58 fármacos para los que se requiere o recomienda la reali- zación de una prueba genética, el 65.5% se pueden tes- tar con técnicas basadas en hibridación, y este porcentaje asciende al 78.1% en los fármacos con variantes acciona- bles. Estas técnicas son de muy alto rendimiento y per- miten estudiar varios tipos de variantes genéticas, incluso alteraciones complejas. Sin embargo, su coste es elevado y requieren de un análisis posterior con escáneres y sof- twares específicos que puede resultar complejo. Por otro lado, la secuenciación, principalmente la secuenciación MUNDO Biotec Biomarcadores
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