Revista Farmabiotec Número 5

50 farmaBIOTEC #5 El papel de la NGS en la oncología de precisión Nos encontramos en una nueva era en la que, el conocimiento clínico, histopatológico y de imagen, junto al estudio genómico, aúnan fuerzas con el objetivo de que los pacientes oncológicos puedan beneficiarse de un estudio exhaustivo y personalizado para un manejo clínico óptimo. DRA. INÉS CALABRIA, Departamento de Oncología de Health in Code. MARINA CÍSCAR, Departamento de Oncología de Health in Code. Durante las dos últimas décadas, hemos visto cómo la secuenciación de última generación (NGS) ha evolucionado rápidamente y se ha instaurado como tecnología estándar en diversos ámbitos, no solo en los centros de investigación, sino también en los hospitales y laboratorios diagnósticos, como una herramienta más en el manejo clínico de pacientes. En el campo de la oncología, esta nueva tecnología ha permitido redefinir las bases genéticas del cáncer y ha propiciado impor- tantes avances en la “oncología de precisión”, mejorando los paradigmas del diagnóstico y tratamiento tradicionales. Tradicionalmente, los tumores han sido clasificados y posteriormente tratados en función de su estratificación patológica y su origen. Sin embargo, la gran heterogeneidad espacio-temporal tumoral que existe en cuanto a su compor- tamiento tras el tratamiento, o entre tumor primario y metás- tasis en un mismo individuo 1 , sumada a la diversidad entre pacientes, han propiciado un impulso a los esfuerzos para desarrollar nuevas terapias dirigidas que requieren un abor- daje individual y específico de cada caso. Es por ello que el concepto de “medicina de precisión” en el área de la onco- logía cobra cada vez más protagonismo, con el objetivo de dirigir la terapia más adecuada a cada paciente teniendo en cuenta, no solo los aspectos clínicos e histopatológicos, sino también el perfil genético y molecular del tumor 2 . En este contexto, el desarrollo de nuevas tecnologías como la NGS ha permitido la caracterización de las alteraciones genéticas tumorales de cada paciente, con una alta sensibili- dad, en un plazo breve y a un coste asequible. La NGS permite secuenciar un genoma completo, toda la región codificante de este (exoma) o determinados genes concretos, y puede detectar, en un solo análisis, diferentes alteraciones genéticas clínicamente relevantes, como mutaciones, indels, alteracio- nes del número de copias (CNVs), reordenamientos, inestabi- lidad de microsatélites, etc. Accionabilidad y decisiones terapéuticas La Sociedad Europea de Oncología Médica (ESMO) recomienda el uso de NGS en muestras tumorales de cáncer de pulmón no microcítico avanzado, cáncer de próstata, cáncer de ovario y colangiocarcinoma 4 . Cabe destacar que, cuando nos encontra- mos en un contexto clínico, es importante seleccionar paneles NGS que estén principalmente enfocados en el estudio de aque- llos biomarcadores que sean accionables, es decir, para los que existan fármacos aprobados, ensayos clínicos en los que se haya demostrado mayor sensibilidad a un tratamiento, o bien, que con- dicionen el pronóstico o el diagnóstico molecular del paciente. Otros productos NGS disponibles en el mercado incorporan tam- bién biomarcadores cuya implicación clínica está aún en estudio y pueden ser útiles en determinados contextos de investigación, pero no se recomienda tomar decisiones terapéuticas en base a estas. Además de su aplicación clínica en la caracterización mole- cular tumoral de cada paciente, la NGS ha jugado un papel muy importante en el desarrollo de nuevos fármacos dirigidos. Gracias a esta tecnología, el conocimiento sobre genes y vías de señali- zación alteradas en los diferentes tipos tumorales ha aumentado sustancialmente, lo cual abre la puerta al desarrollo de nuevos fármacos dirigidos a estas alteraciones. Como consecuencia, el número de ensayos clínicos que testan la efectividad de inhibi- dores de moléculas pequeñas o anticuerpos monoclonales en el tratamiento de diversos cánceres con un determinado perfil molecular aumenta continuamente. En este contexto, los ensayos convencionales pierden protago- nismo y lo ganan los llamados master protocols . La aparición de este nuevo concepto de ensayo ha permitido un enorme incre- mento de la eficiencia en el desarrollo clínico de fármacos, impli- cando un número menor de pacientes y recursos. En la actuali- dad, es habitual encontrar ensayos rápidos de fase 1 de escalada MUNDO Biotec Terapia y diagnóstico génico